2013年1月1日から12月31日までの売上げを集計し発表した。

丸善書店のベスト10は、
1位　講談社
2位　ＫＡＤＯＫＡＷＡ
3位　集英社
4位　小学館
5位　新潮社
6位　ダイヤモンド社
7位　文藝春秋
8位　学研マーケティング
9位　幻冬舎
10位　日本経済新聞出版社

ジュンク堂書店のベスト10は、
1位　講談社
2位　ＫＡＤＯＫＡＷＡ
3位　集英社
4位　小学館
5位　新潮社
6位　学研マーケティング
7位　文藝春秋
8位　岩波書店
9位　ダイヤモンド社
10位　幻冬舎

2012年対比では、ダイヤモンド社が両書店でワンランクアップ。
また、日本経済新聞出版社が丸善書店でワンランクアップし、ベスト10圏内にランクインした。

両書店の2013年出版別売上ベスト300は下記の通り（PDFをダウンロード）。
丸善書店BEST300　／　ジュンク堂書店BEST300